O emblema da Fraternidade data de 1989, um ano após a aprovação canónica da mesma, por Decreto do Bispo de Santarém, e a aprovação dos seus primeiros Estatutos.

Do emblema da Fraternidade fazem parte três elementos essenciais: arco gótico, âncora e uma frase em latim. Na sua explicação pode ler-se: «O arco gótico é convite incessante e porta aberta para a evangelização, segundo a nossa forma própria: pela oração, estilo de vida, serviço e anúncio da Palavra de Deus.

A âncora, símbolo da esperança que temos no fundo da alma, (Heb 6,19) dá consistência à nossa vida e encoraja-nos a anunciar o Evangelho aos nossos contemporâneos na esperança de dias melhores, já no tempo presente, projectando-se a sua plenitude para a escatologia.

As letras em latim ‘EUNTES ET PRAEDICATE EVANGELIUM’ traduzem o imperativo que Jesus fez aos seus discípulos e nos faz hoje a nós Franciscanas Evangelizadoras de Nossa Senhora da Esperança: IDE E ANUNCIAI O EVANGELHO».